Dewan Yayasan

SMP Islam Al-Azhar 13 Surabaya berada di bawah naungan Yayasan Pesantren Islam Al-Azhar (YPIA) yang berkantor pusat di Kompleks Masjid Agung Al-Azhar di Jl. Sisingamangaraja Kebayoran Baru Jakarta Selatan. 

Karena berada di wilayah Jawa Timur, SMP Islam Al-Azhar 13 berada di bawah pengawasan langsung Yayasan Pesantren Islam Al-Azhar (YPIA) Cabang Jawa Timur. 

Dewan Yayasan yang menaungi sekolah ini adalah sebagai mana terlihat pada daftar di bawah ini.

PEMBINA

Ketua Pembina

:

Prof. Dr. Jimly Asshiddiqie, SH

Sekretaris Pembina

:

Muhammad Suhadi, S.Kom

Anggota Pembina

:

Drs. Mas’adi Sulthani, MA

Anggota Pembina

:

Drs. Rostian Syamsuddin

Anggota Pembina

:

Drs. Muhammad Nazif, SE, MBA.

Anggota Pembina

:

Dr. Muhammad Anwar Ratnaprawira, MA

PENGAWAS

Ketua Pengawas

:

Dr. Ir. Ahmad Husin Lubis, M.Sc

Anggota

:

Dr. Shobahussurur, MA

Anggota 

:

Dr. Fadlansyah Lubis, S.H

Anggota 

:

Ir. Dede Gusman, MBA

Anggota 

:

Dwi Yulianti, S.H

PENGURUS

Ketua Umum

:

Dr. Fuad Bawazier, MA

Ketua (Membidangi Pendidikan Dasar & Menengah)

:

Drs. Nuri Muhammadi

Ketua (Membidangi Dikti, Diklat & Pengembangan)

:

Prof. Dr. Suparji, MH

Ketua (Membidangi Dakwah & Sosial)

:

Dr. Zahrudin, M.A

Sekretaris Umum

:

Drs. Budiyono, M.Pd

Sekretaris 

:

Drs. Ono Ruhiana, M.Pd

Bendahara Umum

:

Dr. Ir. Suhaji Lestiadi, ME

Bendahara

:

M. Teguh Kriswanto BKA, SE

PENGURUS

Ketua 

:

Dr. Bambang Tutuko, S.E., M.M., CFP.

Sekretaris

:

Drs. Nuzuar, M.Pd.

Bendahara

:

Bambang Sunarto, Bc.Ak.